/   Новости медицины   /   Коронавирус COVID-19 - есть вопросы? Мы даем ответы!

Коронавирус COVID-19 - есть вопросы? Мы даем ответы!


Коронавирус COVID-19 - есть вопросы?  Мы даем ответы!

В течение последних месяцев нам много говорят о пандемии COVID-19 и вызывающем ее вирусе SARS-CoV-2. Так же в информационном пространстве "летает" много различных слухов и альтернативной информации - правдивой и не очень. Мы все время узнаем много нового - но так ли все на самом деле?

Количество научных статей об вирусе SARS-CoV-2 увеличивается и увеличивается, тем не менее все еще остается много темных областей относительно его происхождения.

Давайте будем брать во внимание только официальные утверждения и посмотрим как все будет выглядеть под разными углами зрения.

Итак. От каких видов животных этот вирус передался человеку?

Нам одни ученные генетики ответили и предъявили доказательства, что наибольшей вероятностью такой передачи является путь ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ - ЧЕЛОВЕК. Другие ученные генетики утверждают, что промежуточная передача произошла через пальмовых цивет или через ящеров, или через ... другой вид диких животных. Все версии хороши - главное что бы путь передачи оставался в границах модели ЖИВОТНОЕ-ЧЕЛОВЕК.

Ладно. Если брать за основу эту модель, то понятна и возможность распространения и передачи вируса человеку - через рынок с дикими животными (близкий контакт или употребление в пищу).

Тогда другой вопрос почему именно в китайской провинции Хубэй, а не где либо еще? Почему это не произошло в другом месте, где тоже есть эти животные и условия для возможного распространения, ПРИРОДНО МУТИРУЮЩЕГО вируса подобные? 

Из официальных данных в декабре 2019 года 27 человек из первых 41 госпитализированных люде (это примерно 66% человек), находились на рынке, расположенном в центре города Ухань в провинции Хубэй, где продаются дикие животные. Однако нам никак не могут предоставить медицинские данные по т.н. первичному пациенту (пациент №0). Причем реальному пациенту.

Возможно такое положение вещей станет понятно, если принять во внимание этот факт: согласно первичному исследованию материала, от самого первого выявленного случая заболевания человека вирусом SARS-CoV-2, с дальнейшей проработкой перемещений станет ясно, что пациент Уханьской больницы с "ПЕРВЫМ ВЫЯВЛЕННЫМ СЛУЧАЕМ" вообще НИКОГДА не посещал этот рынок! ...

Более того оценка молекулярного датирования, основанная на геномных последовательностях SARS-CoV-2, указывает на их довольно таки СТРАННОЕ происхождение (часть генома имеет странный не природный характер - по крайней мере трудно представить природную возможность подобной мутации), причем во временном промежутке октябрь-ноябрь 2019 года.

Это поднимает дальнейшие вопросы о реальности связи между пандемией COVID-19 и дикой природой.

Геномные данные

После предоставления лабораторных образцов было произведено секвенирование генома вируса SARS-CoV-2. Сравнительный геномный анализ показал, что SARS-CoV-2 относится к группе бета-коронавирусов и что он очень близок к SARS-CoV , ответственному за эпидемию нетепичной пневмонии, которая появилась в ноябре 2002 года в китайской провинции Гуандун, после чего распространилась на 29 стран.

Тогда, как впрочем и сейчас, утверждалось, что источником передачи вируса человеку были летучие мыши рода Rhinolophus (потенциально указывается на возможный путь мутации вируса у нескольких видов пещерных летучих мышей). Известно, что летучие мыши были резервуаром этого вируса. Однако подобным резервуаром могла бы стать и  пальмовая циветта (Paguma larvata). Причем по секвентальным совпадениям пальмовые циветты вполне могли служить в качестве промежуточного хозяина (по крайней мере у первых случаев заболеваний людей).

Существует много бета-коронавирусов. Некоторые из них могут быть и у людей. Но интересно то, что пока только 3 из них ведут себя иначе при контакте с человеком. Они отличаются в геноме и мутационных проявлениях и даже наводят на мысль о неприродном происхождении. Причем если говорить о SARS-CoV (2003-2004 годов), то там прямо заявлялось, что "клон" этого вируса был выделен в нескольких лабораториях. Сегодня говорится и подтверждается то, что вирусы SARS-CoV и SARS-CoV-2 в последовательностях генома очень похожи между собой. Их идентичность, по оценкам разных специалистов, составляет около 96%. Возникает вопрос:

Если SARS-CoV мог быть искусственным (по крайней мере при повторной малой вспышке эпидемии атипичной пневмонии) и он очень похож с теперешним SARS-CoV-2, то что же тогда мы имеем сегодня?

Вернемся обратно к природным носителям коронавирусов. Например, было обнаружено, что другой выделенный из летучей мыши вирус RaTG13 был описан как очень похожий на SARS-CoV-2.Следовательно животные, причем разных видов, могут быть носителями одновременно нескольких, очень похожих между собой смертельных вирусов, при этом они остаются лишь резервуаром.

Как это надо понимать и оценивать?

В данном случаи резервуар - это один или несколько видов животных, которые не очень чувствительны к определенному вирусу или не очень чувствительны к группе вирусов, находящихся в них. В естественных условиях, они каким то образом не имеют никаких симптомов заболевания. Тем не менее эти же вирусы в мутагенных проявлениях в других организмах становятся довольно опасными и в конце концов даже смертельными. Не воздействие вируса на живой организм (клетки-хозяина) объясняется одним очень важным параметром - эффективностью работы их иммунной системы, которая позволяет бороться с чрезмерным распространением вируса.

Механизм рекомбинации

7 февраля 2020 года, в результате исследований, ученые из Китая при содействии австралийских коллег обнаружили вирус очень похожий на SARS-CoV-2. Однако последовавшее я этим обзорное исследование показало, что геном коронавируса, выделенного из малазийского панголина (Manis javanica), похож на SARS-Cov-2, только с 90% геномной согласованностью. Это менее чем геномная согласованность с вирусом от летучей мыши. Это как бы указывает на то, что вирус, выделенный из ящера, не несет ответственности за эпидемию COVID-19, которая в настоящее время бушует. Но...

96% схожести коронавирусов летучей мыши и сегодняшнего коронавируса у человека приходится на весь геном. Если взять конкретно его S сегмент (ген S, кодирует белок, расположенный на поверхности вирусной оболочки, и ответственен за присоединение вируса к клетке-хозяину), то в этом сегменте схожесть коронавирусов летучей мыши и человека будет 76,8%. Однако коронавирус, выделенный из панголина, в специфической области белка S, сходен с тем же сегментом коронавируса человек на 99%. Он так же более соответствует 74 аминокислотам, участвующим в связывающем домене рецептора ACE2 (ангиотензин-превращающий фермент 2), который позволяет вирусу проникать в человеческие клетки и заражать их. 

Это означает, что коронавирус, выделенный из панголина, более способен проникать в клетки человека, но менее идентичен вирусу SARS-Cov-2, тогда как коронавирус, выделенный из летучей мыши более идентичен вирусу SARS-Cov-2, но менее способен проникать в клетку человека. Возникает такая вот, на первый взгляд парадоксальная ситуация. Но это лишь на первый взгляд.

Более детальные геномные сравнения в конкретных частях (сегментах) показывают, что вирус SARS-Cov-2 является результатом рекомбинации между двумя различными вирусами. Причем один участок (репликативный шаблон) близок к вирусу летучей мыши, а другой ближе к вирусу панголина. Другими словами, это химера между двумя ранее существовавшими вирусами. Значение химера обычно употребляется в переносном смысле, для обозначения чего то необоснованного или несбыточного. Однако в случаи с Novel Coronavirus (2019-nCoV) / COVID-19 - это ОКАЗАЛОСЬ ВОЗМОЖНЫМ!

Еще очень важно понимать, что рекомбинация приводит к новому вирусу, потенциально способному инфицировать новый вид хозяина. Однако, чтобы произошла подобная рекомбинация в природных условиях, необходимо, что бы два, расходящихся между собой вируса, ОДНОВРЕМЕННО инфицировали клетку-хозяина в один и тот же период времени в одном и том же организме. В это ОЧЕНЬ, ОЧЕНЬ и ОЧЕНЬ трудно поверить при природной мутации. Однако в лаборатории, искусственным способом это сделать вполне возможно!

Так, что следующих два вопроса пока остаются без утвердительного ответа:

В каком организме произошла эта "ПРИРОДНАЯ" рекомбинация? 

И, прежде всего, при каких условиях эта "ПРИРОДНАЯ" рекомбинация происходила, учитывая, что летучая мышь и панголин в естественной природе не ВСТРЕЧАЛИСЬ НИКОГДА?

На сегодняшний день "ОФИЦИАЛЬНАЯ" версия первичного источника возникновения пандемии SARS-CoV-2 гласит - источником были летучие мыши.

Но для того, чтобы вирус передался от летучей мыши человеку, необходимо промежуточное животное - это хорошо известный факт. Причем в предыдущих короновирусных эпидемиях, (SARS-CoV и MERS-CoV), такие промежуточные животные хотя бы были обозначены. При последней пандемии COVID-19 переходный вид животных, в котором вирус SARS-CoV-2 мутировал бы до "человеческого" варианта, до сих пор НЕ НАШЛИ!!!

Официально отвечают вот так:

Поскольку рынок в Ухане, с которым связывают начало вспышки новой коронавирусной инфекции, был ликвидирован, поиск промежуточного животного-переносчика коронавируса не представляется возможным.

Отличительной особенностью нового коронавируса SARS-CoV-2 является его способность к быстрому распространению. Это тоже отличает его от двух предыдущих пандемиологических "собратьев" (SARS-CoV и MERS). Однако в отличии от них не столь опасна, так как имеет меньшую летальность (около 9,6%, для SARS-CoV, около 36%, для MERS и пока около 5,4%, для COVID-19 (SARS-CoV-2) соответственно).

Для справки:

Самым максимально передающимся между людьми вирусом, является вирус кори. Один человек может заразить корью следующих 11-18 человек.  

SARS-CoV-2 может передаться 3-4 людям.

Как реально может протекать болезнь COVID-19?

  • Бессимптомная, легкая или постельная форма болезни будет у 81,5% человек
  • Госпитализация потребуется около 13,8% людей
  • Интенсивная терапия будет необходима 4,7%

Причем болезнь в большинстве своем поражает старшую вековую котегорию людей - более 83% заболевших людей, требующих медицинское вмешательство или интенсивную помощь, составляют люди в возрасте 60+ лет.

Где и как SARS-коронавирус может проникнуть в клетку-хозяина?

Ген ACE2 кодирует ангиотензинпревращающий фермент-2, который, как было доказано, является рецептором как для SARS-коронавируса (SARS-CoV), так и для респираторного коронавируса человека NL63. Исследования и анализы показывают, что ACE2 может быть рецептором хозяина для нового коронавируса 2019-nCoV/SARS-CoV-2.

И хотя, исходя из официальных заявлений, систематический анализ вариантов кодированых-областей, в ACE2 и eQTL вариантах, не выявил прямых, генетически подтвержденных доказательств, существования мутантов ACE2, устойчивых к связыванию S-белка коронавируса в разных популяциях, в реальности наблюдается, что, в популяциях Восточной Азии, AFs, Novel Coronavirus (2019-nCoV) / SARS-CoV-2 / COVID-19 в вариантах eQTL оказался гораздо выше, и был связан с более высокой экспрессией ACE2 в тканях. Это указывает на то, что в разных популяциях в сходных условиях 2019-nCoV/SARS-CoV-2 имеет различную восприимчивость и/или реакцию.

В определенных частях вирусного генома SARS-CoV-2 наблюдались "природные странности" НЕ ПРИРОДНОГО происхождения. Например, в сегментах nsp3, nsp12, Orf8b, Orf9. Кстати эти же "природные странности" наблюдались в последней фазе эпидемии SARS в 2004 году.

ВОПРОСЫ? ВОПРОСЫ? ВОПРОСЫ?

ДЛЯ СПРАВКИ:

Описание действия вирусных генов и белков а так же клеточные ответы на их действие

Пояснение к описанию: В начале приводиться номенклатура гена (в скобках указанно количество аминокислотных остатков), далее описывается генный продукт и/или его характеристика, а так же возможное влияние данного гена на клеточный ответ хозяина

Orf1a/b. Неописан

nsp1 (180). Экспрессия способствует деградации эндогенных мРНК хозяина, которые могут ингибировать синтез белка хозяина и предотвращать накопление эндогенной мРНК IFN-β. Индуцирует экспрессию CCL5, CXCL10 (IP10) и CCL3 в эпителиальных клетках легких человека посредством активации NF-κB, так же усиливает деградацию клеточной РНК, что может способствовать репликации SARS-CoV или блокировать иммунные ответы.

nsp2 (638). Удаление ослабляет рост вируса и последующий синтез РНК.

nsp3 (1922). Папаиноподобная протеаза 2, осуществляет протеолитическую обработку вирусного полипротеина в 3 сайтах и ??принимает участие в синтезе сегмента субгеномной РНК. Другое действие осуществляется через АДФ-рибоза-1-фосфатазу (ADP-ribose 1-phosphatase), которая дефосфорилирует Appr-1 ?-p (побочный продукт клеточного сплайсинга тРНК), в АДФ-рибозу. Предполагаемая каталитическая триада (Cys1651-His1812-Asp1826) и цинк-связывающий сайт обладают деубиквитинирующей активностью; эта неожиданная активность в дополнение к ее папаин-подобной протеазе предлагает новую вирусную. стратегию для модуляции механизма убиквитинирования клеток-хозяев.

nsp4 (500). Неописан.

nsp5 (306). 3C-подобная протеаза, осуществляет протеолитический процессинг репликативного полипротеина в 11 специфических сайтах с ??образованием ключевых функциональных ферментов, таких как репликаза и геликаза. При SARS-CoV остановка роста и апоптоз с помощью активности каспазы-3 и каспазы-9 были продемонстрированы в 3CLpro-экспрессирующих клетках человеческого промоноцита с повышенной активацией ядерного фактора κB-зависимого репортера.

nsp6 (290). Неописан.

nsp7 (83). Ядерное магнито-резонансное исследование обнаружило потенциальные сайты для белковых взаимодействий. Пока описана лишь трехмерная структура.

(198). Предполагаемая РНК-зависимая РНК-полимераза является кристаллической структурой гексадекамера nsp7-nsp8 и обладает центральным каналом с положительным электростатическим свойствам и размерам, благоприятными для связывания нуклеиновых кислот. Вероятно, это еще одна уникальная РНК-зависимая РНК-полимераза большого генома.

nsp9 (113). Трехмерная кристаллическая структура димера, который связывает вирусную РНК и взаимодействует с nsp8.

nsp10 (139). Кристаллическая структура которая имеет функцию связывания нуклеиновых кислот в более крупном комплексе РНК-связывающих белков для транскрипции и репликации вирусных генов. Специфически взаимодействует с субъединицей NADH 4L и цитохромоксидазой II с деполяризацией внутренней митохондриальной мембраны трансфицированного фибробласта легкого человека. Обладает выраженным цитопатическим эффектом.

nsp11 (13). Неописан.

nsp12 (932). РНК-зависимая РНК-полимераза осуществляет репликацию и транскрипцию для получения РНК обоюдополярную размерность гена с субгеном.

nsp13 (601). Геликаза (дНТфазная и РНК 5'-трифосфатазная активность)

nsp14 (527). 3'→5'-экзорибонуклеаза. Ее необычная 3′→5′-экзорибонуклеазная активность дополняет эндорибонуклеазную активность в репликации генома гигантской РНК.

nsp15 (346). Уридилат-специфическая РНК-эндонуклеаза, которая критически участвует в цикле репликации коронавируса.

nsp16 (298). Предполагаемая 2'-O-рибоза метилтрансфераза (2′-O-ribose methyltransferase).

Orf2 (1,255). Спайковый белок. Связывается с рецептором клетки-хозяина ACE2 и другими корецепторами, опосредует проникновение вируса в клетки-хозяева как вирусный слитый белок типа 1. Однако для эффективного S-опосредованного проникновения вируса требуется подкисление эндосом. Для слияния необходимо активация протеазы и протеолитическое расщепление обильно экспрессирующим фактором Xa, для связи с мембранами вируса и инфицированных клеток (S1 и S2). Т-клетки (после IL-2 активации) реагируют на трансфицированные ACE2, которые могут образовывать связь с экспрессирующим вирусным шипом с последующим, значительным накоплением белка S в эндоплазматической сети, что может модулировать репликацию вируса, тем самым усиливать острую легочную недостаточность.

Orf3a (274). Образует чувствительный к калию ионный канал, способствуя почкованию и последующему выделению вируса. Сверхэкспрессия Orf3a в клеточной линии может вызвать апоптоз. Его экспрессия в эпителиальных клетках легких A549 повышает уровень мРНК и внутриклеточный и секретируемый уровень всех трех субъединиц - альфа, бета и гамма, а так же фибриногена. При сверхэкспрессии Orf3a также наблюдается усиление производства воспалительных хемокинов (в больших количествах активируются при инфекции SARS-CoV).

Orf3b (154). В основном локализуется в ядрышке разных трансфицированных клеток. Orf3b ингибирует экспрессию IFN-β при синтезе и передаче сигналов. При экспрессии Orf3b клетки могут подвергаться одновременному некрозу и апоптозу уже через 6 часов после трансфекции, однако это действие может наступить и в более поздние моменты времени.

Orf4 (76). Белок оболочки, который в плоских липидных бислоях создает ионные каналы, которые становятся более проницаемы для одновалентных катионов, по сравнению с проницаемостью одновалентных анионов. Предположительно участвует в зародышеобразовании и высвобождении вируса. Со временем вызывает индуцированный апоптоз в трансфицированных Т-клетках Jurkat, особенно в отсутствие факторов роста.

Orf5 (221). Мембранный поверхностный белок ответственный за вирусную сборку и почкование. М-белок индуцирует апоптоз в клетках, который может быть подавлен ингибиторами каспазы.

Orf6 (63). Мембранный белок, который ускоряет репликацию и вирулентность рекомбинантного мышиного коронавируса. Ингибирует синтез и передачу сигналов IFN. Ингибирует ядерную транслокацию, но не фосфорилирование STAT1. Orf6 локализуется в эндоплазматической сети/мембране Гольджи инфицированных клеток, связывает и нарушает формирование ядерного импортного комплекса, привязывая кариоферин альфа 2 и кариоферин бета 1 к мембране. Такое удержание комплекса приводит к потере транспорта STAT1 в ядро, несмотря на индуцированную вирусной РНК передачу сигналов IFN. Таким образом Orf6 блокирует экспрессию STAT1-активированных генов, которые необходимы для установления антивирусного состояния.

Orf7a (122). Уникальный трансмембранный белок типа I, который участвует в сборке вируса путем взаимодействия с М и Е (необходимы для формирования вирусоподобных частиц при совместной экспрессии с S и N). Экспрессия Orf7a индуцирует апоптоз через каспазо-3-зависимый путь в клеточных линиях, происходящих из разных органов, однако особенно в легких, почках и печени.

Orf7b (44). Неописан.

Orf8a (39). Orf8a был локализован в митохондриях, а его избыточная экспрессия приводила к увеличению митохондриального трансмембранного потенциала, продукции активных форм кислорода, активности каспазы-3 и клеточного апоптоза. Orf8a усиливает репликацию вируса и вызывает апоптоз через митохондриально-зависимый путь.

Orf8b (84). Может модулировать репликацию вируса.

Orf9 (422). Нуклеокапсидный белок. Проводит связывание и упаковку вирусной РНК в сборке вириона, N-антагонизированным IFN путем ингибирования синтеза IFN-β. Может вызывать воспаление легких путем активации экспрессии гена COX-2 путем связывания непосредственно с промотором, что приводит к воспалению через многочисленные сигнальные каскады COX-2. Приводит к индуцированно реорганизацийи актина в клетках, лишенных факторов роста.

Orf9b (98). Кристаллическая структура Orf9b может участвовать в прикреплении к мембране и ассоциироваться с внутриклеточными везикулами, что указывает на то, что Orf9b играет одну из ролей в сборке вириона.

Смертность от Covid19 пока не повлияла на статистику общей годовой смертности в Европе.

Запоследние годы фициальные статистические данные по 24 странам Европы показывают, что не только общая смертность не увеличивается, но, пока, фактически намного ниже последних средних годовых и промежуточных показателей.

Приведенные статистические данные были собраны European Monitoring of Excess Mortality for Public Health Action (EuroMOMO - Европейским агентство по мониторингу смертности). Приведенные данные возникли в результате международного партнерства учреждений из 24 европейских стран. Цель такого сбора данных декларируется, как содействие обеспечению готовности к чрезвычайным ситуациям в области общественного здравоохранения.

Данный проект отслеживает "избыточную смертность", то есть число официально зарегистрированных смертей по сравнению со средней смертностью. Kаждая страна дана с разбивкой по возрастной демографии.

Как видим на 12 неделе 2020 года (19-25 марта) в подавляющем большинстве стран Европы нет избытка смертности. Это означает, что смертность находится на ожидаемом уровне. 

Единственным очевидным исключением является Италия. Но обратите внимание, что смертность классифицируется как "высокaя" (High 5;7), но не "очень высоко" (Very high >7), как, например, это было в Европе в предыдущие годы.

Итак сегодня, в Европе, Италия является страной, максимально пораженной пандемией коронавируса. События в Италии порождают жесткие условия карантина, причем не только в Италии но и других Европейских странах. Главным поводом для этого служит высокая смертность и быстрое распространение вируса.

Однако для сравнения давайте посмотрим на ту же самую карту смертности, только в предыдущие годы (прошу заметить это данные статистики одного и того же агенства).

В 2019 году в Европе в глобальном смысле все было намного хуже.

Во Франции "очень высокая" смертность (Very high >7)

В Испании и Португалии смертность классифицируется как "высокaя" (High 5;7) - на том же уровне, что и сегодня в Италии

Еще в нескольких странах смертность классифицируется "выше среднего"

Тем не менее в 2019 году никакого карантина и блокировок перемещения не было.

ЕСТЬ ВОПРОСЫ?

Это был разгар огромного сезона гриппа 2017-2018 годов. Как видите, Европа тогда тоже довольно таки сильно пострадала в плане "избыточной смертности".

Однако и в 2018 году ничего подобного в плане блокировки перемещения не было. И глобальной эпидемии никто не объявлял.

ОПЯТЬ ЕСТЬ ВОПРОСЫ?

2-я неделя 2017 года по результатам "избыточной смертности" была наверное еще хуже, чем ситуация сейчас, потому, что почти вся западная часть Европы и особенно страны Средиземноморья имели огромный всплеск "избыточной смертности".

И в 2017 году вирус гриппа или "избыточная смертность" в результате чего либо другого не привел к объявлению эпидемии или закрытию границ

Сам собой возникает вопрос:

А может "избыточная смертность" это просто НОРМАЛЬНОЕ ЯВЛЕНИЕ для этого периода года?

Например, в нынешнем виде, пока, показатели "избыточной смертности" 2020 года ниже, чем показатели "избыточной смертности" 2017 года.

Резонен вопрос:

ЕСЛИ НЕ БЫЛО КАРАНТИНА И СВОБОДЫ ПЕРЕМЕЩЕНИЯ НИ В ПЕРВЫХ МЕСЯЦАХ 2017 ГОДА, НИ В 2018 ГОДУ, НИ В 2019 - ТАК ПОЧЕМУ МЫ ВСЕ ЭТО ИМЕЕМ СЕГОДНЯ?


Резерв лекарств 0 шт.